意外なところで引っかかった.... 先日まで元気に動作して実行していた環境が突然,なんの前触れもなくエラーを吐き出したが解決 現象: anaonda で作成した仮想環境上でpandas, numpyが突如動かなくなる エラーの状況: > import pandas as pd ModuleNot…
便利らしいが,落とし穴が... install.packagesに含まれていないので,,,,設定メモwww.bioconductor.org公式のサイトを参考にR Terminal上でインストール ``` >install.packages("BiocManager") >BiocManager::install("ropls") ```あとは,コード上で…
きっかけ WindowsでRをインストールした.だけど,Ubuntuでも使うから(Macもだけど) コケた箇所 git のキーゲット CRANの公式サイトで最後に方法があったこと・・(これは本当に悲しくなった・・ システムの構成 Ubuntu 18.04 R 4.0.2 インストール手順(成…
せっかくデータサイエンスするのであれば,PythonだけでなくRも使えると便利かなと考えて,導入検討をした. 今回,インストール環境は以下の通り. OS: Windows 10 Anaconda すでに導入 jupyter をconda install からインストール python:3.7.3 Rのインス…
ベースの環境でそのまますると,pipのレガシィ関連で2.xと3.xの環境がどうも混ざるぽい・・・ なので環境が壊れてしまう. 仮想環境を作成し, 仮想環境上で設定を行ってから入れていくようにする インストール環境 Windows 10 (Mac OS High Sierra) Python 3…
研究でGUIの開発を行う. 一番手っ取り早い方法は何か,いろいろ考えたけど,まだわからないのでメモ書き まずは,Python自体ですべての作成を考えてみる.ということで調べたら,Kivyとなるものを発見kivy.org インストール環境 Windows 10 (Mac OS High Si…
出張先でも,Codeの確認はしたいものだ. なので,MacBook Pro (Retina, 15-inch, Late 2013)を愛用しています. ぶっちゃけ,このバージョンが一番好きなデバイス. GraphicsがNVIDIA積まれているので・能書きはここまでにしておき,久々に更新MacbookProで…
結構ハマったので,メモBluetoothってこんなにハマるもんなのか,と結構ショック受けました. んで,解決すれば結構さくさくなので,ホッとしてます.参考したのは価格ドットコムでの口コミよりDBA-E11さんからの貴重なレビュー 価格.com - ロジテック LBT-U…
Yosemiteにアップデートしてみました. Homebrewが以下のメッセージで使えなくなりました. /usr/local/bin/brew: /usr/local/Library/brew.rb: /System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/1.8/usr/bin/ruby: bad interpreter: No such file or di…
やっぱりOpenにCodeや技術を公開したいというのがつよく,MATLABちっくを作成しよう!,と思ったので,しばらくは,互換性があるというScilabを導入 (あとは,お仕事関係で,さすがに有償モノで開発を講座するわけにいかなかったので ((あとは,某ゴニョ…
いちいち,プレビュー起動で見るのがめんどくさくなったので. それよりは,displayコマンドで見たほうが楽ちんなことが多いのです. ということで,設定します. 少しハマったので,むむむ??となりました. そのメモメモを兼ねて入れます.Homebrew のイ…
学生さんからのコード記述における質問にて, C言語で複素共役を求めるコードの記述を行いたい. 色々わかったことがあったので,メモ書き サンプルコードはこちらのサイトを介して勉強しました. C言語関数辞典 - conj, conjf, conjl C言語関数辞典 - conj,…
たとえ仕事といえど,何度繰り返し入れまくったかわかりません. これが私です. 今回は,VTK6.2+Qt5.10+MSVS2012でVTK環境を構築します. 環境は Windows 7. メモリ 6GB (←若干上がった♪ IDE Microsoft Visual studio 2012 SP1 ということで,まずはVTKの最…
順調に2ヶ月更新になっていることは気にしないでください. 更新している時間がないので... #と言っても,,,色々実験ノートの一つとして使ってるので,やはり更新は必要です. 今回はITKのインストールを説明します. ITKとは,については,後日記載…
Macports ではSVNなどの設定やら,Proxyの問題がありありです. ちゃんと設定やらをしたらよいのですが,自宅でやら研究室でやら..の研究を行うのであれば,port updateの度に設定を変えるのは正直めんどくさい.なら,proxyに依存したくない! そんな私に…
init.elのとりまとめ. 今はダッシュのメモ書きなので,このスペースはinit.elのための落書き帳としてます.参考にしたサイトは以下のとおり. Youhei SASAKI's official site: Emacsの設定 - 主に org ファイルの読み込み集 uwabamiさんの公式サイトより う…
今回は時間の関係上,VTKに特化したCMakeLists.txtについて記載する.以下に一般的なVTKのCmakeLists.txtを示す. cmake_minimum_required(VERSION 2.8) PROJECT(VTKPolydataSingleObj) find_package(VTK REQUIRED) include(${VTK_USE_FILE}) add_executable…
MexはMATLABの環境(コマンドライン)上で独自のC/C++を呼び出すためのバイナリファイル バイナリファイルということは,バイナリ化が必要です.64bitのシステムでMATLABのMexを行う設定セットアップ環境は以下の通り Windows 7 64bit MATLAB 2007b Visual S…
こういう時期なので、いろいろまとめておく。 OpenNIとKinect for Windows SDKは共存できないと聞く そんなことはなかった。 いろいろ、バリエーションが広がる! Kinect周りの環境設定 Windows 7 64 Bit Visual studio 2010 ultimate SP1 Kinect for Window…
Visual studio 2010 Ultimateを用いたサンプルの実行でエラーが出た。 そのエラーがMSVCP110.dllがないと言われた。探して見ると、どーやらMicrosoft Visual C++ 2010 再頒布可能パッケージが 入っていないというエラー 以下のサイトを参照にさせてもらいま…
参考にしたサイトはこちらから Physics-Station: OpenCV を Visual Studio で使う方法 このサイトの通りにしたら、きれいにいけました。 環境は以下の通り Windows 7 64bit Visual studio 2010 ultimate SP1 OpenCV 2.4.8をインストールする1) 以下のサイト…
だいぶ簡単過ぎて,びっくりした.参考はこちら MacでISOイメージディスクを作成 | EzXNetwork私が改めて說明するまでもないです. 「アプリケーション」から「ユーティリティ」を選択. →「ディスクユーティリティ」をダブルクリックして,DVDに焼きたいデ…
学生さんから質問があったので、おさらいがてらにメモを記述OpenGLのインストールは以下の環境で行いました。 OS:Windows 7 64bit Visual studio 2010 OpenGLのダウンロード 以下からソースを適当なフォルダ上に落とす Nate Robins - OpenGL - GLUT for Win3…
VTKを利用して,C++のCmakeをかけるとPathが通ってないというエラーが発生した. よくわからないので,友人のVTKスペシャルなX博士に相談 なんと,VTKのBuildの時,「Build SHARE LIB」にチェックを入れたのがまずかったらしい*1..つまり,dllができちゃっ…
3D slicer の画像重ね合わせの方法について,記述しておく. まずは,3D slicerの画面構成の画像を提示 説明は画像内でも行ってますので,省略します. もし必要なら,別の機会にでもキレイに記述する予定(あくまで未定ということ)1. 重ねあわせたいVolume…
3D slicerとは,ハーバード大学医学部の関連病院の一つ,Brigham And Women's HospitalのSurgical Planning Lab. で主に開発されている,医用画像の可視化,解析用のオープンソースソフトウェアのことである. 3D slicerの嬉しいところは,以下の部分も非常…
まずは医用画像工学の説明を簡単に #ここで,コメントを頂けますと嬉しいです.医用画像工学 医学(免疫,病理学,解剖,臨床など) 生体系の構造,組織,機能について考察,解析,理解すること 上記の知識を基に,生体機能の正常かを目指した応用技術 画像工…
本日,論文に載っていた式. を変数,をパラメータとして考える 例えば,尤度関数になると, これが,任意の変数で表現すると, また,平均値 ,標準偏差とした時,尤度関数,Gaussianで表現する. 理解した.
正直,この記事を書いてる時もよくわかってません. そもそもPDB fileとは??と考えますが,よくわかりません. ただし,以下のメッセージ,Cannot find or open the PDB fileあまりに気持ち悪い気がしますので,その解決を行う. Visual studioのプロジェ…
VTKが無事インストールされたなら,VTKのSourceとVTKをBuild*1したディレクトリの2つが出来上がるはず. 今回はこの中身について考えてみるSource以下にある,Exampleというディレクトリの構成*2を示す. ├─Examples │ ├─AMR │ │ └─Cxx │ ├─Annotation │ │ …