意外なところで引っかかった．．．． 先日まで元気に動作して実行していた環境が突然，なんの前触れもなくエラーを吐き出したが解決 現象： anaonda で作成した仮想環境上でpandas, numpyが突如動かなくなる エラーの状況： > import pandas as pd ModuleNot…

便利らしいが，落とし穴が．．． install.packagesに含まれていないので，，，，設定メモwww.bioconductor.org公式のサイトを参考にR Terminal上でインストール ``` >install.packages("BiocManager") >BiocManager::install("ropls") ```あとは，コード上で…

きっかけ WindowsでRをインストールした．だけど，Ubuntuでも使うから（Macもだけど） コケた箇所 git のキーゲット CRANの公式サイトで最後に方法があったこと・・（これは本当に悲しくなった・・ システムの構成 Ubuntu 18.04 R 4.0.2 インストール手順(成…

せっかくデータサイエンスするのであれば，PythonだけでなくRも使えると便利かなと考えて，導入検討をした． 今回，インストール環境は以下の通り． OS: Windows 10 Anaconda すでに導入 jupyter をconda install からインストール python：3.7.3 Rのインス…

ベースの環境でそのまますると，pipのレガシィ関連で2.xと3.xの環境がどうも混ざるぽい・・・ なので環境が壊れてしまう． 仮想環境を作成し, 仮想環境上で設定を行ってから入れていくようにする インストール環境 Windows 10 (Mac OS High Sierra) Python 3…

研究でGUIの開発を行う． 一番手っ取り早い方法は何か，いろいろ考えたけど，まだわからないのでメモ書き まずは，Python自体ですべての作成を考えてみる．ということで調べたら，Kivyとなるものを発見kivy.org インストール環境 Windows 10 (Mac OS High Si…

出張先でも，Codeの確認はしたいものだ． なので，MacBook Pro (Retina, 15-inch, Late 2013)を愛用しています． ぶっちゃけ，このバージョンが一番好きなデバイス． GraphicsがNVIDIA積まれているので・能書きはここまでにしておき，久々に更新MacbookProで…

結構ハマったので，メモBluetoothってこんなにハマるもんなのか，と結構ショック受けました． んで，解決すれば結構さくさくなので，ホッとしてます．参考したのは価格ドットコムでの口コミよりDBA-E11さんからの貴重なレビュー 価格.com - ロジテック LBT-U…

Yosemiteにアップデートしてみました． Homebrewが以下のメッセージで使えなくなりました． /usr/local/bin/brew: /usr/local/Library/brew.rb: /System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/1.8/usr/bin/ruby: bad interpreter: No such file or di…

やっぱりOpenにCodeや技術を公開したいというのがつよく，MATLABちっくを作成しよう！，と思ったので，しばらくは，互換性があるというScilabを導入 （あとは，お仕事関係で，さすがに有償モノで開発を講座するわけにいかなかったので （（あとは，某ゴニョ…

いちいち，プレビュー起動で見るのがめんどくさくなったので． それよりは，displayコマンドで見たほうが楽ちんなことが多いのです． ということで，設定します． 少しハマったので，むむむ？？となりました． そのメモメモを兼ねて入れます．Homebrew のイ…

学生さんからのコード記述における質問にて， C言語で複素共役を求めるコードの記述を行いたい． 色々わかったことがあったので，メモ書き サンプルコードはこちらのサイトを介して勉強しました． C言語関数辞典 - conj, conjf, conjl C言語関数辞典 - conj,…

たとえ仕事といえど，何度繰り返し入れまくったかわかりません． これが私です． 今回は，VTK6.2+Qt5.10+MSVS2012でVTK環境を構築します． 環境は Windows 7. メモリ 6GB (←若干上がった♪ IDE Microsoft Visual studio 2012 SP1 ということで，まずはVTKの最…

順調に２ヶ月更新になっていることは気にしないでください． 更新している時間がないので．．． ＃と言っても，，，色々実験ノートの一つとして使ってるので，やはり更新は必要です． 今回はITKのインストールを説明します． ITKとは，については，後日記載…

Macports ではSVNなどの設定やら，Proxyの問題がありありです． ちゃんと設定やらをしたらよいのですが，自宅でやら研究室でやら．．の研究を行うのであれば，port updateの度に設定を変えるのは正直めんどくさい．なら，proxyに依存したくない！ そんな私に…

init.elのとりまとめ． 今はダッシュのメモ書きなので，このスペースはinit.elのための落書き帳としてます．参考にしたサイトは以下のとおり． Youhei SASAKI's official site: Emacsの設定 - 主に org ファイルの読み込み集 uwabamiさんの公式サイトより う…

今回は時間の関係上，VTKに特化したCMakeLists.txtについて記載する．以下に一般的なVTKのCmakeLists.txtを示す． cmake_minimum_required(VERSION 2.8) PROJECT(VTKPolydataSingleObj) find_package(VTK REQUIRED) include(${VTK_USE_FILE}) add_executable…

MexはMATLABの環境（コマンドライン）上で独自のC/C++を呼び出すためのバイナリファイル バイナリファイルということは，バイナリ化が必要です．64bitのシステムでMATLABのMexを行う設定セットアップ環境は以下の通り Windows 7 64bit MATLAB 2007b Visual S…

こういう時期なので、いろいろまとめておく。 OpenNIとKinect for Windows SDKは共存できないと聞く そんなことはなかった。 いろいろ、バリエーションが広がる！ Kinect周りの環境設定 Windows 7 64 Bit Visual studio 2010 ultimate SP1 Kinect for Window…

Visual studio 2010 Ultimateを用いたサンプルの実行でエラーが出た。 そのエラーがMSVCP110.dllがないと言われた。探して見ると、どーやらMicrosoft Visual C++ 2010 再頒布可能パッケージが 入っていないというエラー 以下のサイトを参照にさせてもらいま…

参考にしたサイトはこちらから Physics-Station: OpenCV を Visual Studio で使う方法 このサイトの通りにしたら、きれいにいけました。 環境は以下の通り Windows 7 64bit Visual studio 2010 ultimate SP1 OpenCV 2.4.8をインストールする1) 以下のサイト…

だいぶ簡単過ぎて，びっくりした．参考はこちら MacでISOイメージディスクを作成 | EzXNetwork私が改めて說明するまでもないです． 「アプリケーション」から「ユーティリティ」を選択． →「ディスクユーティリティ」をダブルクリックして，DVDに焼きたいデ…

学生さんから質問があったので、おさらいがてらにメモを記述OpenGLのインストールは以下の環境で行いました。 OS:Windows 7 64bit Visual studio 2010 OpenGLのダウンロード 以下からソースを適当なフォルダ上に落とす Nate Robins - OpenGL - GLUT for Win3…

VTKを利用して，C++のCmakeをかけるとPathが通ってないというエラーが発生した． よくわからないので，友人のVTKスペシャルなX博士に相談 なんと，VTKのBuildの時，「Build SHARE LIB」にチェックを入れたのがまずかったらしい*1．．つまり，dllができちゃっ…

3D slicer の画像重ね合わせの方法について，記述しておく． まずは，3D slicerの画面構成の画像を提示 説明は画像内でも行ってますので，省略します． もし必要なら，別の機会にでもキレイに記述する予定（あくまで未定ということ）1. 重ねあわせたいVolume…

3D slicerとは，ハーバード大学医学部の関連病院の一つ，Brigham And Women's HospitalのSurgical Planning Lab. で主に開発されている，医用画像の可視化，解析用のオープンソースソフトウェアのことである． 3D slicerの嬉しいところは，以下の部分も非常…

まずは医用画像工学の説明を簡単に ＃ここで，コメントを頂けますと嬉しいです．医用画像工学 医学(免疫，病理学，解剖，臨床など) 生体系の構造，組織，機能について考察，解析，理解すること 上記の知識を基に，生体機能の正常かを目指した応用技術 画像工…

本日，論文に載っていた式． を変数，をパラメータとして考える 例えば，尤度関数になると， これが，任意の変数で表現すると， また，平均値 ，標準偏差とした時，尤度関数，Gaussianで表現する． 理解した．

正直，この記事を書いてる時もよくわかってません． そもそもPDB fileとは？？と考えますが，よくわかりません． ただし，以下のメッセージ，Cannot find or open the PDB fileあまりに気持ち悪い気がしますので，その解決を行う． Visual studioのプロジェ…

VTKが無事インストールされたなら，VTKのSourceとVTKをBuild*1したディレクトリの２つが出来上がるはず． 今回はこの中身について考えてみるSource以下にある，Exampleというディレクトリの構成*2を示す． ├─Examples │ ├─AMR │ │ └─Cxx │ ├─Annotation │ │ …